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针对于临床病原体诊断技术的迫切新需求，在2019年2月，出具了《宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识》，共识中指出宏基因组二代测序技术（Metagenomic Next Generation Sequencing, mNGS）作为一种新型DNA/RNA测序方法，对脓毒症、免疫抑制宿主病发严重感染、重症肺部感染等疾病具有较高的临床应用价值，能够快速、精准地找到病原体；另外对于抗菌药物治疗方案的制定和治疗效果的评估具有一定的指导作用。

mNGS技术相比传统的病原体检测方法而言：第一，无需培养，可直接从临床样本出发，通过随机引物扩增样本中的所有核酸序列，理论上能无偏倚地检测出所有潜在病原体(包括细菌、真菌、病毒、寄生虫、支原体、衣原体、立克次氏体、螺旋体等，甚至可以用于新病原体的发现，对于早期诊断疑难感染病例和合理用药具有重大意义；第二，mNGS技术较传统方法可更快地获知证据，快速地进行病原体的全基因组测序和各病例菌株之间的进化分析，判读医院感染暴发，进而帮助医院采取及时、有效的预防措施阻止或减缓感染性疾病暴发。

协云基因基于宏基因组二代测序技术（mNGS，metagenomic next-generation sequencing）研发的不明病原体检测服务，可根据自主研发的实验技术和自主建设病原体知识库，快速全面检测临床样本（痰液、血液、粪便等）中各种类型的病原体（包括细菌、DNA病毒、RNA病毒、真菌和寄生虫等）。服务于重症感染人群的不明病原体和新发病原体进行检测，可以一次性的全面检测出临床样本中各种类型的DNA病原体和RNA病原体，帮助判别感染与否，并给出病原体耐药及毒力信息，辅助感染性疾病的检测诊断和合理用药，同时可对不同患者的感染病原体进行进化溯源分析，快速判断院内感染暴发，对于有效的预防阻止或减缓感染性疾病暴发也有着重要的意义。