产品介绍
产品简介
扩增子测序，即对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序，主要包括16S rDNA测序、18S rDNA测序及ITS测序等。扩增子测序通常是选择某个或某几个变异区域，利用保守区设计通用引物进行PCR扩增，然后对高变区进行测序分析和菌种鉴定，具有所需样本量少、高通量和高精确性等特点。
数据分析策略
1.从测序所得的原始数据出发，首先对原始数据进行质控，得到有效数据（Clean Data）；
2.基于有效数据进行OTUs（Operational Taxonomic Units）聚类；
3.根据OTUs聚类结果，一方面对每个OTU的代表序列做物种注释，得到对应的物种信息，另一方面将各个样品的有效数据，和代表序列进行比对，获得对应OTU在各个样品中的丰度分布情况；
4.基于构建好的OTU丰度表，获得不同分类层级的物种丰度表；
5.基于OTU丰度表及不同分类层级的丰度表，进行样品微生物群落组成分析；
6.基于OTU丰度表及不同分类层级的丰度表，进行Alpha多样性和Beta多样性分析；
7.根据研究需求，可选择高级分析，深入挖掘样品中的物种组成和差异。
数据分析内容
| 分析类别 | 分析内容 | |
| 样品微生物群落组成分析 | 样品菌落组成柱状图 | |
| Heatmap图 | ||
| 样品间OTU分布Venn图 | ||
| Alpha diversity分析 | 多样性指数统计 | |
| 稀释曲线（Rarefaction Curve） | 多样性组间差异 | |
| Chao1曲线 | ||
| Shannon-Wiener 曲线 | LEfSe分析 | |
| Rank-Abundance 曲线 | ||
| Beta diversity分析 | 样品间相似性指数 | |
| PCoA分析 | ||
| 样品聚类分析 | ||
| 高级分析菜单 | RDA/CCA 分析 | NMDS分析 |
| 关联分析 | Network分析 | |
| PICRUSt 分析 | 随机森林分析 | |
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