病毒宏基因组测序又称宏病毒组(Virome),是在宏基因组学理论上,结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支。宏病毒组是一种新兴的病毒组学研究技术,它突破了传统技术方法的局限。宏病毒组直接以环境中所有病毒的遗传物质为研究对象,能够快速准确的鉴定环境中所有的病毒组成,从而是一种发现新病毒,监控病毒变异的病毒学研究的有力手段。
1. 从测序所得到的原始数据出发,首先对原始数据进行质控,得到有效数据(Clean data);
2. 基于有效数据进行物种注释,同时获得不同层级的病毒丰度表;
3. 基于不同分类层级的丰度表,进行样品病毒组成分析;
4. 基于不同分类层级的丰度表,进行多样性分析和统计分析;
5. 根据分析需求,可选择高级分析,深入挖掘样品中病毒组成和差异,以及单个病毒物种组装。
分析类别 | 分析内容 |
病毒组成分析 | 病毒组成柱状图 |
Heatmap图 | |
Krona图 | |
多样性分析 | Alpha多样性分析 |
PCoA分析 | |
样品聚类分析 | |
附加分析 | Wilcoxon秩和检验分析 |
单个病毒物种组装 |
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